1512'de Özbeklerden Karşi'yi alan Safevi başkomutanı Necm-i Sâni, bilinmeyen bir motivasyonla şehrin 15 bin kişilik ahalisinin tamamını öldürttü
Özbeklerin Maveraünnehr'i fethetmelerine mani olamayan Babür Şah, Şah İsmail Safevi'den yardım istedi, Şah İsmail de en güvendiği devlet adamlarından biri olan Necm-i Sâni önderliğinde büyük bir orduyu yardıma yolladı.
Karşi kenti 3 günlük muharasayla fethedildi, şehir kolay elde edilmiş olmasına ve bir katliamı gerektirecek bilinen bir sebep olmamasına rağmen Necm-i Sâni tüm ahalinin kılıçtan geçitilmesini emretti.
Babür; Karşi ahalisine merhamet edilmesi için ricacı oldu ancak Necm-i Sâni kulak asmayarak katliamı gerçekleştirtti. Kendi halkının katledilmesine iştirak etme hissiyatı Babür'ün Safevilerle kurduğu ittifaktan tiksinmesine neden oldu.
Katliamı işleyen Safevi ordusu aynı yıl içinde Gazdevan Muharebesi'nde Ubeydullah Han komutasındaki Özbek ordusu tarafından imha edildi, Necm-i Sâni savaş meydanında ölürken Babür az sayıda sadık askerleriyle firar ederek canını kurtardı.
Karşi katliamı ve Gazdevan yenilgisiyle Maveraünnehr'de itibarı tükenen Babür, vatanını Özbeklerden geri alma umudunu yiterek Hindistan'a yöneldi... Maveraünnehr halkı Özbeklerle karışarak onları asimile etti kendileri de Özbek kimliğini benimsedi.